Hur RNA-fragment från människa hjälper hepatit E-viruset

by Albert
Karaktärisering av genererade artificiella insertioner i HEV HVR. Kredit: Nature Communications (2024). DOI: 10.1038/s41467-024-49219-8

Varför blir hepatit E kronisk hos vissa patienter, och varför fungerar inte medicinerna? För att ta reda på detta observerade ett internationellt forskarlag under ledning av forskare från Bochum en patient med kronisk hepatit E-infektion under ett år.

Upprepad sekvensering av virusets RNA visade att viruset införlivade olika delar av värdens budbärar-RNA i sitt genom. Detta resulterade i en replikationsfördel, vilket kan ha bidragit till att infektionen blev kronisk.

”Det så kallade införandet av värd-RNA kan möjligen förutsäga övergången från en akut infektion till ett kroniskt tillstånd”, säger Dr. Daniel Todt, chef för forskningsgruppen Computational Virology vid institutionen för medicinsk och molekylär virologi vid Ruhr University Bochum i Tyskland.

Forskarna rapporterar i tidskriften Nature Communications den 6 juni 2024.

Sekvensering av viruspopulationen

Omkring 20 miljoner människor världen över drabbas av hepatit E varje år. Normalt läker infektionen ut utan konsekvenser, men den kan vara livshotande för gravida kvinnor eller personer med nedsatt immunförsvar. I vissa fall blir den kronisk. Det finns inga specifika effektiva mediciner. Det bredspektrumantivirala läkemedlet Ribavirin används också mot hepatit E, men det fungerar inte alltid.

Hur kan viruset undvika immunförsvaret? Varför blir infektionen kronisk och läker inte ut? Forskarna ville ta reda på detta och analyserade för första gången alla viruspopulationer hos en kroniskt infekterad patient under en period på mer än ett år. De undersökte mer än 180 enskilda sekvenser från blodprover i detalj.

Eike Steinmann och Daniel Todt från professuren för molekylär och medicinsk virologi. Kredit: Ruhr-Universitaet-Bochum

Eike Steinmann och Daniel Todt från professuren för molekylär och medicinsk virologi. Kredit: Ruhr-Universitaet-Bochum

Replikering i cellkultur gynnas av värd-RNA

”Hepatit E-viruset har en så kallad hypervariabel region i sin genetiska information, i vilken det kan införliva olika RNA-sekvenser från värdceller”, säger Todt.

Hans team kunde visa att sammansättningen av denna region förändrades kraftigt under observationsperioden. Dessutom förekom många olika sammansättningar samtidigt. I cellkulturförsök visade det sig att införlivandet av värd-RNA gav en replikationsfördel: De förändrade virusen kunde replikera bättre än andra.

”Vi antar att detta delvis är orsaken till att infektionen blir kronisk och att behandlingen misslyckas”, säger Todt.

Forskarna undersökte sammansättningen av det värd-RNA som införlivats i viruset för att avgöra om det fanns några gemensamma drag som kännetecknar gensegmenten.

”Vi kunde dock inte upptäcka några meningsfulla likheter”, säger Todt. De inkorporerade gensekvenserna är till övervägande del sådana som är mycket vanliga i värdceller, vilket tyder på ett slumpmässigt urval.

”Det är möjligt att det under hepatit E-infektionen uppstår en kapplöpning mellan viruset och immunsystemet i kroppen”, spekulerar Todt. Om viruset lyckas införliva värd-RNA innan immunförsvaret framgångsrikt bekämpar infektionen kan det leda till ett kroniskt förlopp.

”Värd-RNA i virusgenomet skulle i vilket fall som helst kunna fungera som en biomarkör i den akuta fasen av en infektion och tidigt indikera att den sannolikt kommer att bli kronisk.”

Forskarna planerar att utvidga sina studier till att omfatta större patientkohorter.

Ytterligare information: Michael Hermann Wißing et al, Genetic determinants of host- and virus-derived insertions for hepatitis E virus replication, Nature Communications (2024). DOI: 10.1038/s41467-024-49219-8

Related Articles

Leave a Comment