Läkemedel som verkar mot bakterier utvärderas huvudsakligen utifrån hur väl de hämmar bakterietillväxt under laboratorieförhållanden.
En avgörande faktor är dock om de aktiva substanserna faktiskt dödar patogenerna i kroppen. Forskare vid universitetet i Basel har presenterat en ny metod för att mäta hur effektivt antibiotika dödar bakterier.
Antibiotikaresistenta bakterier är ett av vår tids största hälsoproblem. På grund av mutationer blir bakterier alltmer resistenta mot vanliga läkemedel, vilket gör dessa infektioner allt svårare att behandla.
Men även utan resistens kan bakterier ibland motstå antibiotika, särskilt om bakterierna befinner sig i ett vilande tillstånd. Även om de inte reproducerar sig i detta tillstånd, dödas de inte heller av antibiotika. Detta gör att bakterierna kan vakna och börja växa igen vid ett senare tillfälle, till exempel efter att antibiotikabehandlingen har avslutats.
Särskilt när det gäller tuberkulos och andra komplexa infektioner, som tar många månader att behandla, är det avgörande att välja läkemedel som dödar bakterierna och helt steriliserar infektionen.
Tidigare laboratorietester rapporterade främst om ett läkemedel hindrade bakterierna från att växa – inte om bakterierna faktiskt dog.
Forskare under ledning av Dr Lucas Boeck från Institutionen för biomedicin vid Universitetet i Basel och Universitetssjukhuset i Basel har utvecklat en ny metod för att bättre kunna förutsäga behandlingens framgång. De beskriver denna nya metod i tidskriften Nature Microbiology.
Filma enskilda bakteriers öde
Metoden, som forskarna kallar ”antimikrobiell encellstestning”, baseras på mikroskopisk avbildning av miljontals enskilda bakterier under tusentals olika förhållanden.
”Vi använder den för att filma varje enskild bakterie under flera dagar och observera om och hur snabbt ett läkemedel faktiskt dödar den”, förklarar Lucas Boeck. Detta gör det möjligt att mäta exakt hur stor andel av bakteriepopulationen som elimineras av behandlingen och hur effektivt.
För att demonstrera sin metod testade forskarteamet 65 kombinationsbehandlingar på tuberkulospatogenen Mycobacterium tuberculosis. Forskarna testade också metoden på bakterieprover från 400 patienter med en annan komplex lunginfektion orsakad av Mycobacterium abscessus, som är besläktad med tuberkulospatogenen.
Skillnader observerades först mellan olika terapier och sedan mellan olika bakteriestammar hos olika patienter. Experter kallar det senare för antibiotikatolerans. Efterföljande analyser visade att vissa genetiska egenskaper är ansvariga för hur väl bakterierna kan ”sitta ut” antibiotikabehandlingen.
”Ju bättre bakterierna tolererar ett antibiotikum, desto mindre är chanserna till terapeutisk framgång för patienterna”, sammanfattar Lucas Boeck resultaten. Jämfört med data från kliniska studier och djurmodeller gav resultaten från antimikrobiella encellstester en mycket god bild av hur väl de olika terapeutiska medlen utrotar infektioner.
Fördelar för patienter och läkemedelsutveckling
Den nya metoden har hittills använts som ett forskningsverktyg, men den kan också komma att användas inom klinik och industri i framtiden. En dag kan den vara till nytta både för patienter och för läkemedelsutveckling på flera sätt, förklarar Lucas Boeck.
”Vår testmetod gör det möjligt för oss att skräddarsy antibiotikabehandlingar specifikt för de bakteriestammar som finns hos enskilda patienter.”
Han tillägger att en bättre förståelse av den underliggande genetiken en dag kan göra det möjligt att utföra ännu enklare och snabbare antibiotikatoleranstester och även bidra till att förbättra uppskattningarna av nya läkemedels effektivitet under utvecklingen.
”Sist men inte minst kan data hjälpa forskare att bättre förstå överlevnadsstrategierna hos patogener och därmed lägga grunden för nya, mer effektiva terapeutiska metoder”, säger Boeck.
Mer information: Storskaliga tester av antimikrobiell dödlighet med enkelcellsresolution förutsäger utfallet av mykobakteriella infektioner, Nature Microbiology (2026). DOI: 10.1038/s41564-025-02217-y
